真嗣在祭拜母亲归途中遭遇第七使徒突袭，关键时刻明日香驾驶二号机如闪电般切入战场。这位自信张扬的少女与沉默的绫波丽截然不同，三人驾驶零号、初号及二号机并肩作战，在抵抗第八使徒的惨烈攻势中，微妙的情愫悄然滋长。随着第九、十使徒接踵而至，生与死的界限变得模糊，少年们被迫直面前所未有的残酷考验。
有人看见庵野秀明借碇源堂之口对过去的自己告别，用一场未完成的聚餐和一个没扇下去的巴掌，缝合了旧版中那些极端又拧巴的伤口。曾经破碎的心之壁仿佛时间倒流般复原，那种“不必与世界决裂也能让爱复活”的温柔，取代了过往毁灭式的杂乱与美丽。虽然新画面窗明几净、战斗华丽流畅，少了几分原始血腥的粗粝感，但这或许正是创作者想传达的信号：了解痛苦的人，才懂如何温柔待人。
巨大的机器人成了隔绝外界的移动密室，少年少女在这狭小空间里依旧能在世界中心呼唤爱。当日式拉门内的私密心声被外力强行暴露，绝望之余却闪烁着微弱的希望，这与后续作品的灰暗形成了鲜明镜像。哪怕身处万劫不复的末日，只要还能救回心中的天使，一切就都来得及，这大概就是观众最想看到的结局。
