这部特别篇对原作剧情进行了多处关键调整，故事背景设定在死神界，增加了死神留克讲述关于月亮的新增场面。随着叙事重心的转移，伊出这一角色并未在本作中登场，使得人物关系网更加聚焦于核心冲突。
夜神总一郎心脏病发作的经典桥段被完全删除，他在第二次基拉事件期间的活动地点也从医院病房改为了街头。月与 L 的初次会面地点变更为放映室，这一空间转换让两人的心理博弈在封闭环境中显得更为紧张。L 在此过程中敏锐地洞察到基拉对于第二个基拉出现的反应，进一步推动了智斗的升级。
搜查过程中的细节也有所变动，松田误入松柏集团会议室时的场景，从原本的工作间转移到了搜查本部的房间。关于雷姆消失的情节，作品删去了她留下笔记以及月亮拾取笔记本的描写，直接省略了第三本笔记本的相关线索，使故事脉络更紧密地衔接后续发展。
结局部分的悲剧色彩更加浓烈且具体，部分干部的死亡原因不再统一为心脏麻痹，而是改为各具特色的个别死因。三堂从建筑物高处坠落身亡，纸村伫立在车站铁轨上被电车轧死，而奈南川则死于交通事故，这些改动强化了现实的残酷感。
影片最后，在日本搜查本部成员于 L 墓前宣誓的新增画面中，众人继承了遗志继续追查真相。整部作品通过删减冗余支线与重塑关键场景，呈现出一个节奏紧凑、逻辑自洽的独立篇章，为《死亡笔记》的故事画上了独特的句号。
